Primer6 32位修改版是一款由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计评估软件,Primer6 x86版主要界面是分为序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和纹基分析窗口(Motif),本站提供Primer6 32位修改版下载。
Primer6 32位修改版功能
软件的主要功能分四种
即引物设计、限制性内切酶位点分析、DNA 基元(motif)查找和同源性分析功能。
前三种为其主要功能。
此外,该软件还有一些特殊功能
其中最重要的是设计简并引
另外还有序列"朗读"、DNA 与蛋白序列的互换、语音提示键盘输入等等。
Primer6 32位修改版特色
1、CR引物设计:设计引物对用于PCR和多重实验。
2、跨物种:扩增来自多个物种的序列。
3、致病性检测:在高度保守的区域中定位寡核苷酸。
4、等位基因特异性:仅扩增一组相关序列中的单个成员。
5、简并:从氨基酸序列开始,反向翻译并自动设计低简并区域的寡核苷酸。
6、嵌套/多重:检查多个候选寡核苷酸之间的同源性。
7、限制酶和基序分析:从数据库中选择800多种酶和200种常见基序。
8、Clustal W比对:使用任何资源(包括EBI)在执行ClustalW比对后加载比对序列。
9、多序列比对:使用流行的Clustal W算法来对齐桌面上的序列(仅适用于Windows版本)。
10、算法:使用Breslauer值计算Tm,长PCR-处理最多50 KB的序列。
Primer6 32位修改版特色
可以针对模板DNA 的来源以相应的遗传密码规则转换DNA 和氨基酸序列。
软件共给出八种生物亚结构的不同遗传密码规则供用户选择
有纤毛虫大核(Ciliate Macronuclear)、无脊椎动物线粒体(Invertebrate Mitochondrion)
支原体(Mycoplasma)、植物线粒体(Plant Mitochondrion)
原生动物线粒体(Protozoan Mitochondrion)、一般标准(Standard)
脊椎动物线粒体(Vertebrate Mito-chondrion)和酵母线粒体(Yeast Mitochondrion)。
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